魔女兵器是个怎样的游戏？
魔女兵器游戏是一个讲述了男主拯救了世界，第二天起床发现自己变成了女孩子的正统本格严肃策略游戏。
2017年，亨利博士在意大利一间教堂的地下室发现了一个会自发产生电波的铜制箱子（第0号异质物品），飞机却在运回国途中坠机从此消失，同时世界各地的设备都检测到了大量的杂讯爆发现象。对当时产生的杂讯的解析，成为了人类对异质科学研究的开端。对异质物品的研究打破了原有的力量均衡，世界陷入了为期十四年的混乱和战争，几个依靠异质技术武器化而形成的势力奠定了新世界的格局。战后为应对民众高涨的反战情绪，幸存的六大势力统一将自己研究异质技术的都城改名为“学园都市”。
出生在新和平时代的主角（男）是第五学园都市——新丰洲市的一名学生。在参观研究所时遭遇了劫持事件，绑匪的行为导致一件属性不明的异质物品失控毁灭了整座城市：硫磺与火从天而降，两千三百万市民全部化为盐柱。主角因躲避绑匪藏身于一面古老的石壁中逃过一劫。面对地狱一般的末世景象，少年在废墟中许愿希望这一切都未发生过……
谁知一道白光后主角突然醒来，发现新丰洲市完好如初……可是，等等！我、我怎么变成了女孩子了？？！！！
从此少女开始了一路结识魔女的羁绊之路~